固氮菌肥料是含有大量好氣性自生固氮菌的微生物肥料。自生固氮菌不與高等植物共生，沒有寄主選擇，而是獨立生存與土壤中，利用土壤中的有機質或根系分泌的有機物作碳源來固定空氣中的氮素，或直接利用土壤中的無機氮化合物。固氮菌在土壤中分布很廣，其分布主要受土壤中有機質含量、酸堿度、土壤濕度、土壤熟化程度及速效磷、鉀、鈣的含量等影響。
    （1）固氮菌對土壤酸堿度反應敏感，其最適宜pH為7.0~7.5，酸性土壤上施用固氮菌肥時，應配合施用石灰以提高固氮效率。過酸、過堿的肥料或有殺菌作用的農(nóng)藥，都不宜與固氮菌肥混施，以免發(fā)生強烈的抑制。
   （2）固氮菌對土壤濕度要求較高，當土壤濕度是田間最大持水量的20%~40%時才開始生長，60%~70%時生長最好。因此，施用固氮菌肥時要注意土壤水分條件。
   （3）固氮菌是中溫性細菌，最適宜生長溫度為25~30℃，低于10℃或高于40℃時，并要保持一定的溫度，嚴防暴曬。
    （4）固氮菌只有在碳水化合物豐富而又缺少化合態(tài)氮的環(huán)境中，才能充分發(fā)揮固氮作用。土壤中碳氮比低于40~70：1時，固氮作用迅速停止。土壤中適宜的氮比是固氮菌發(fā)展成優(yōu)勢菌種、固定氮素最重要的條件。因此，固氮菌最好在富含有機質的土壤上，或與有機肥料配合施用。
    （5）土壤中施用大量氮肥后，應隔10天左右再施固氮菌肥，否則會降低固氮菌的固氮能力。但固氮菌劑與磷、鉀及微量元素肥料配合施用，則能促進固氮菌的活性，特別是在貧瘠的土壤上。
    （6）固氮菌肥適用于各種作物，特別是對禾本科作物和蔬菜中的葉菜類效果明顯。固氮菌肥一般用作拌種，隨拌隨播，隨即覆土，以避免陽光直射。也可蘸根或作基肥施在蔬菜苗床上，或與棉花蓋種肥混施。也可追施于作物根部，或結合灌溉追施。