一、外形區(qū)別
木瓜樹為灌木或者小喬木，高可達5-10米。小枝在初期時顏色為紫紅色，有毛，兩年后生枝無毛，變?yōu)樽虾稚?，冬芽為半圓形，先端較圓鈍。
木瓜海棠屬于落葉灌木后至小喬木，高為2-6米。小枝顏色為紫褐色，無毛。冬芽為三角卵形，先端為急尖。
二、葉片區(qū)別
木瓜樹的葉片為橢圓卵形或者橢圓長圓形，很少部分為倒卵形，初期時下面有很多黃白色絨毛，不久之后將脫落干凈。
木瓜海棠的葉片為橢圓形或者披針形后至倒卵披針形，初期時上面無毛，下面有褐色絨毛，以后也會脫落幾乎無毛。
三、果實區(qū)別
木瓜樹果實形狀為長橢圓形，顏色為暗黃色。而木瓜海棠的果實為卵球形或者接近圓柱形，顏色為黃色表層帶有一點紅暈。
